肛门镜检查前，患者要先排空大小便。检查时按医生的要求，摆好体位，放松全身，放松肛门，不要夹紧两侧臀部。在肛门镜插入时最好大口呼气。随着肛门镜的插入，患者可能有便意感或轻度疼痛、不适，这时也要忍受，配合医生做完检查，切勿将身子回缩或收缩腹部。
乙状结肠镜检查是利用最长30cm的硬质筒状器械经肛门插入肠腔，在直视下观察直肠及其上方乙状结肠的一种检查方法。检查的意义基本同直肠镜检查，但检查可达更高部位。通常在检查前一天晚上要服用通便药排空肠腔内的粪便。检查前还要排空小便，换穿干净无臭的袜子和鞋，再带一些卫生纸备用。条件允许时可由一位家属陪同。做乙状结肠镜检查前可以吃饭，因为食物经口摄入到达乙状结肠需要相当长的时间，故不会对检查造成明显影响。不吃饭的话，体质虚弱者还容易发生低血糖或体力不支现象，甚至出现晕厥。 乙状结肠镜检查通常采用“膝胸位”，采用这种体位，患者虽然有些不舒服，但只需数分钟，最多10分钟，即可检查完毕，一般人都能耐受。
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